Los ríos más largos del mundo y de Colombia transcurren en el área de jurisdicción de Corpoamazonia

El río Amazonas con una longitud de 6.800 km es el más caudaloso, ancho, profundo y largo del mundo. En su paso por Colombia, 117 km del río transcurren por el Departamento del Amazonas y drena con sus aguas a la cuenca más grande de la tierra. Al interior de esa cuenca, se encuentra la totalidad del área de jurisdicción de Corpoamazonia.

El río Caquetá o río Yapurá en Brasil, es un largo río amazónico que tiene una longitud de 2.280 km, de los cuales 1.200 km corresponden a Colombia y el resto a Brasil. Este río nace en el Macizo Colombiano, en el Páramo de las Papas, a unos 10 km del nacimiento del río Magdalena. Sus principales afluentes son los ríos Apaporis, Caguán y Orteguaza.

El río Putumayo, tiene una longitud de 2.063 km, de los cuales, 1.580 km son navegables entre Puerto Asís en Putumayo y Tarapacá en Amazonas, 1.500 km discurren por Colombia, es el río más largo que circula al interior del país. Nace en el Macizo Colombiano y define las fronteras entre Colombia, Ecuador y Perú. Sus principales tributarios por su margen izquierda aguas abajo son los ríos Piñuña Blanco, Caucayá, Cara Paraná, Sabaloyaco, Igará Paraná, y Pupuña.

Por la margen derecha los ríos San Juan, Orito, Acaé, Guamués, San Miguel, Güeppí, Peneya, Angusilla, Yuvineto, Campuya, Eré, Algodón, Mutún, Esperanza, Yaguas, Cotuhé y Pureté.

El río Apaporis tiene una longitud de 805 km, es afluente del río Caquetá, fluye por los Departamentos de Guaviare, Caquetá, Vaupés y Amazonas.

Como referente, otros ríos de Colombia tienen las siguientes longitudes: Meta: 2.200 km, Magdalena: 1.558 km, Cauca: 1.350 km, Guaviare: 1.350 km, Atrato: 700 km